地点：黄浦校区

        上海交通大学医学院图书馆定位为“医学分馆”，前身为上海第二医科大学图书馆，与医学院计算机网络信息中心共同位于上海交通大学医学院信息资源中心。该中心位于上海交通大学卢湾校区，成立于2002年10月，其前身是由上海第二医科大学图书馆与计算机网络信息中心合并成立的上海第二医科大学信息资源中心。 1952年院系调整，以原震旦医学院、圣约翰医学院和同德医学院的图书馆藏书为基础，组建成为上海第二医科大学图书馆。2005年上海第二医科大学并入上海交通大学，成立上海交通大学医学院，该图书馆遂更名为上海交通大学医学院图书馆，并成为上海交通大学图书馆的分馆。 该分馆现用馆舍于1987年竣工，建筑面积为10,199.50平方米，其中图书馆面积8,300平方米，阅览室面积为3,215平方米，有座位共687个；馆舍包括四个专题阅览室，一个电子阅览室及一个古籍阅览室。该分馆藏书约56.88万册，有医学类电子文献数据库35个，电子全文期刊4,000多种，其中期刊约有1,500种。目前该分馆有注册读者1.4万多名，每年流通图书9万多册，每周开放时间为96小时。 信息资源中心一至三楼供图书馆使用，一楼为文献采集部，有演讲厅、陈列室、文献检索实验室及各专题阅览室等；二楼为流通阅览部和读者服务部，有中西文期刊阅览室及多媒体阅览室等；三楼为流通阅览部，有西文图书阅览室等。